El altar principal es del siglo XVI, cuyo titular es Nuestra Señora del Pópulo Romano, se encuentra en el interior de una hornacina rematada en arco de medio punto decorado en su rosca mediante molduras de medallones circulares y marcos cuadrados sin decoración interior alguna realizados en yeso, mientras que en el intradós de dicho arco y en las jambas de la hornacina la decoración es de medallones ovalados (el superior romboidal) cuyas molduras contienen unas pulidas piedras convexas.
Con este altar y otras pinturas que le rodean se conforma un Retablo cuyo centro es el lienzo de Nª Sª del Pópulo Romano, que fue traído de Roma en el año 1591 por Fray Luis Dávila, hermano del fundador de la capilla.
En el centro de la predela del altar figura una inscripción que indica que el mismo fue elaborado a expensas de Francisco Dávila, fundador de esta capilla, así como del canónigo Juan Dávila y de Diego de Haro Montoya.